Le décret 2020-1310 du 29 octobre 2020 en vigueur stipule :

• Article 45 : les bibliothèques territoriales (type S) ne peuvent accueillir de public, et sont donc fermées. Cela implique également qu’il n’y a plus d’accueil de classes ou de groupes.
• Article 34 : les bibliothèques (BU) et centres de documentation relevant des établissements d’enseignement supérieur peuvent accueillir sur RDV.
• La préfecture du département peut toujours décider de restreindre ou interdire ce qui est autorisé dans le décret.

Le « click and collect » est permis, tel que cela est mentionné sur le site du gouvernement : 
« Les bibliothèques et librairies seront fermées au public. Il sera néanmoins possible d’aller y retirer des livres sous un format « click and collect ». » 
(source : site du gouvernement, rubrique Questions/réponses, puis Pour ma vie sociale)
Une mise à jour du décret sera faite pour clarifier cela, a priori d’ici une semaine.